全国用户服务热线

基因功能注释质控管理系统

基因功能注释质控管理系统
基因功能注释质控管理系统是一种用于评估基因功能注释结果可靠性和一致性的软件系统。基因功能注释是将未知基因序列的功能与已知的基因功能进行关联的过程,它对于理解基因功能和遗传疾病的发生机制具有关键作用。然而,由于基因功能注释涉及多种数据和方法,结果的质量和一致性一直是一个重要的问题。该系统通过对注释结果进行质控评估来解决这个问题。它首先采用多种功能注释工具对基因进行注释,并生成注释结果。然后,该系统会对不同注释结果进行比较和分析,评估它们之间的一致性和可靠性。该系统还可以根据用户需求和相关标准,设置不同的质控指标和阈值,以便更精确地评估注释结果的质量。此外,该系统还具备可视化功能,可以将注释结果以图形化的方式展示出来,方便用户进行结果的分析和比较。用户可以通过该系统的界面进行交互操作,选择不同的注释工具和设置质控参数,以满足其自身的需求。总的来说,基因功能注释质控管理系统是一种能够评估基因功能注释结果质量和一致性的软件系统,可以提高注释结果的可靠性,促进基因功能研究的进展。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 基因组装 N50值、GC含量、各个亚组件数目等
2 基因预测 预测的基因数目、基因长度、编码蛋白质大小、序列运动元件的数目等
3 基因注释 SNP位点数目、GO注释等
4 基因组比较 保守基因的数目、基因家族的数目等
5 突变检测 SNP位点数目、Indel数目、连线不一致位置等
6 结构变异 插入序列数目、缺失序列数目、倒位序列数目、反向序列数目等
7 癌症基因变异检测 基因突变类型、癌症相关的功能注释、临床重要性评估、突变位点信息等
8 功能富集分析 富集分析的注释项、注释项的富集P值、反富集分析等
9 转录组分析 转录本表达量、异常表达基因、基因表达模式、基因表达差异分析等
10 变异检测 变异的数目、纯合性和杂合性变异、拷贝数变异、结构变异、动态变异等
11 染色体空间结构 染色体三维结构、空间相互作用基因、染色质互作、空间组织等
12 SNP分析 SNP位点数目、杂合性SNP、纯合性SNP、SNP效应等
13 功能影响预测 非同义突变、功能损失突变、生物学对功能的预测、缺失或增加功能等
14 表达调控 差异表达基因、转录因子结合位点、转录因子调控网络、非编码RNA等
15 病毒基因组分析 病毒基因组序列、病毒基因的突变、蛋白质结构预测、病毒基因的功能注释等
16 RBP结合位点 RNA结合蛋白位点、RBP结合位点功能、基因调控网络等
17 SNP位点注释 位点在基因中的位置、功能预测等
18 编码RNA鉴定 编码RNA的数目、mRNA长度、开放阅读框的数目等
19 缺失突变分析 突变位置信息、突变类型、突变相关功能注释、缺失突变的影响等
20 非编码RNA鉴定 非编码RNA的数目、长链非编码RNA、微小RNA、环形RNA等
TAG标签:基因 / 功能 / 注释 / 质控  HOT热度:39
主页 QQ 微信 电话
展开