*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 基因组装 | N50值、GC含量、各个亚组件数目等 |
2 | 基因预测 | 预测的基因数目、基因长度、编码蛋白质大小、序列运动元件的数目等 |
3 | 基因注释 | SNP位点数目、GO注释等 |
4 | 基因组比较 | 保守基因的数目、基因家族的数目等 |
5 | 突变检测 | SNP位点数目、Indel数目、连线不一致位置等 |
6 | 结构变异 | 插入序列数目、缺失序列数目、倒位序列数目、反向序列数目等 |
7 | 癌症基因变异检测 | 基因突变类型、癌症相关的功能注释、临床重要性评估、突变位点信息等 |
8 | 功能富集分析 | 富集分析的注释项、注释项的富集P值、反富集分析等 |
9 | 转录组分析 | 转录本表达量、异常表达基因、基因表达模式、基因表达差异分析等 |
10 | 变异检测 | 变异的数目、纯合性和杂合性变异、拷贝数变异、结构变异、动态变异等 |
11 | 染色体空间结构 | 染色体三维结构、空间相互作用基因、染色质互作、空间组织等 |
12 | SNP分析 | SNP位点数目、杂合性SNP、纯合性SNP、SNP效应等 |
13 | 功能影响预测 | 非同义突变、功能损失突变、生物学对功能的预测、缺失或增加功能等 |
14 | 表达调控 | 差异表达基因、转录因子结合位点、转录因子调控网络、非编码RNA等 |
15 | 病毒基因组分析 | 病毒基因组序列、病毒基因的突变、蛋白质结构预测、病毒基因的功能注释等 |
16 | RBP结合位点 | RNA结合蛋白位点、RBP结合位点功能、基因调控网络等 |
17 | SNP位点注释 | 位点在基因中的位置、功能预测等 |
18 | 编码RNA鉴定 | 编码RNA的数目、mRNA长度、开放阅读框的数目等 |
19 | 缺失突变分析 | 突变位置信息、突变类型、突变相关功能注释、缺失突变的影响等 |
20 | 非编码RNA鉴定 | 非编码RNA的数目、长链非编码RNA、微小RNA、环形RNA等 |