全国用户服务热线

序列组装与注释管理系统

序列组装与注释管理系统
序列组装与注释管理系统(SequenceAssemblyandAnnotationManagementSystem,SAAMS)是一种用于管理和分析生物学序列的软件系统。它可以接收来自各种基因测序技术的原始序列数据,并将其组装成完整的基因组或转录组序列。SAAMS具有高效的序列组装功能,它能够识别和连接重叠的序列片段,从而生成连续的、一致的序列。此外,它还能处理复杂的模式和重复序列,提高组装的准确性和完整性。SAAMS还拥有强大的序列注释功能,它可以根据已知的生物学信息和数据库,对组装好的序列进行注释。这包括基因结构预测、ORF预测、蛋白质功能注释等。注释信息可以帮助研究人员更深入地了解生物序列的功能和特征。SAAMS还提供数据管理和可视化功能,可以将组装和注释结果与其他实验数据集成,方便用户进行数据查询、分析和可视化展示。此外,SAAMS还支持数据共享和协作,多个用户可以同时进行序列组装和注释的操作,实现团队合作和数据共享。总之,序列组装与注释管理系统是一种功能强大的软件工具,可用于高效地管理和分析生物学序列数据,为生物学研究提供重要的支持。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 序列导入 序列文件名、序列长度、序列来源、序列质量等
2 序列预处理 测序平台、测序方法、测序质量阈值、样品标签等
3 质量控制 N碱基数、低质量序列数、碱基偏好性、前后连接序列等
4 基因组组装 基因组长度、平均覆盖度、接头序列数、重复序列数等
5 读段拼接 拼接长度、拼接错误率、拼接后序列数、拼接成功率等
6 直接组装 组装长度、组装后序列数、组装成功率、N50值等
7 序列比对 比对对象、参考序列、比对质量阈值、比对率等
8 物种注释 物种名称、物种类型、相似度阈值、注释种类等
9 基因注释 基因名称、基因类型、区域信息、编码蛋白产物等
10 功能注释 功能名称、功能类型、生物过程、分子功能等
11 表达量分析 RPKM值、差异表达基因数、上调基因数、下调基因数等
12 差异分析 差异物种、差异类型、显著性阈值、显著差异个数等
13 遗传变异分析 变异类型、变异频率、密度分布、突变位点等
14 进化分析 系统树构建方法、进化模型、进化分支、进化速率等
15 互作网络分析 蛋白互作关系、互作网络图、蛋白复合物、互作网络拓扑等
16 可变剪接分析 剪接形式、剪接异构体数、剪接事件、可变剪接因子等
17 行为分析 基因表达时间、组织特异性、行为差异、响应刺激等
18 病因分析 致病性突变、相关疾病、通路分析、基因突变频率等
19 药物分析 药物靶点、药物相互作用、药物代谢、药物抗性等
20 数据可视化 数据图表类型、图表样式、图表标题、横纵坐标等
TAG标签:序列 / 组装 / 注释  HOT热度:42
主页 QQ 微信 电话
展开