*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 序列导入 | 序列文件名、序列长度、序列来源、序列质量等 |
2 | 序列预处理 | 测序平台、测序方法、测序质量阈值、样品标签等 |
3 | 质量控制 | N碱基数、低质量序列数、碱基偏好性、前后连接序列等 |
4 | 基因组组装 | 基因组长度、平均覆盖度、接头序列数、重复序列数等 |
5 | 读段拼接 | 拼接长度、拼接错误率、拼接后序列数、拼接成功率等 |
6 | 直接组装 | 组装长度、组装后序列数、组装成功率、N50值等 |
7 | 序列比对 | 比对对象、参考序列、比对质量阈值、比对率等 |
8 | 物种注释 | 物种名称、物种类型、相似度阈值、注释种类等 |
9 | 基因注释 | 基因名称、基因类型、区域信息、编码蛋白产物等 |
10 | 功能注释 | 功能名称、功能类型、生物过程、分子功能等 |
11 | 表达量分析 | RPKM值、差异表达基因数、上调基因数、下调基因数等 |
12 | 差异分析 | 差异物种、差异类型、显著性阈值、显著差异个数等 |
13 | 遗传变异分析 | 变异类型、变异频率、密度分布、突变位点等 |
14 | 进化分析 | 系统树构建方法、进化模型、进化分支、进化速率等 |
15 | 互作网络分析 | 蛋白互作关系、互作网络图、蛋白复合物、互作网络拓扑等 |
16 | 可变剪接分析 | 剪接形式、剪接异构体数、剪接事件、可变剪接因子等 |
17 | 行为分析 | 基因表达时间、组织特异性、行为差异、响应刺激等 |
18 | 病因分析 | 致病性突变、相关疾病、通路分析、基因突变频率等 |
19 | 药物分析 | 药物靶点、药物相互作用、药物代谢、药物抗性等 |
20 | 数据可视化 | 数据图表类型、图表样式、图表标题、横纵坐标等 |