*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据导入 | 文件名、样本编号、实验时间、测序平台、测序类型、数据格式、测序质量等 |
2 | 数据预处理 | 样本编号、过滤质量阈值、过滤长度阈值、低复杂性序列过滤、修剪引物序列、防重复处理等 |
3 | 质量控制 | 样本编号、过滤质量阈值、过滤长度阈值、N含量检测、低质量碱基判断等 |
4 | 序列比对 | 样本编号、参考序列、比对算法、序列匹配率、比对质量、比对结果等 |
5 | 变异检测 | 样本编号、变异类型、突变位置、突变频率、突变效果、变异注释等 |
6 | 基因表达分析 | 样本编号、基因表达水平、基因差异分析、表达矩阵、样本分组等 |
7 | 功能注释 | 基因名称、功能注释结果、通路注释、GO注释、KEGG注释、蛋白结构预测等 |
8 | 变异频率统计 | 样本编号、参考基因、变异频率、突变类型、样本分组、统计结果等 |
9 | 控制比对与过滤 | 样本编号、比对算法、比对质量、过滤质量阈值、过滤长度阈值、过滤N含量阈值等 |
10 | 基因组装 | 样本编号、参考序列、组装方法、组装质量、组装结果、合并结果等 |
11 | 基因功能预测 | 样本编号、基因序列、功能预测结果、功能注释、通路注释、基因家族预测等 |
12 | 性状关联分析 | 样本编号、性状数据、基因变异、变异频率、相关性分析、关联结果等 |
13 | RNA序列分析 | 样本编号、表达矩阵、差异基因分析、基因表达水平、样本分组、关联分析等 |
14 | 配对分析 | 样本编号、基因变异、变异类型、位点信息、亲缘关系、配对统计等 |
15 | 基因组重测序 | 样本编号、参考基因组、重新测序方法、组装质量、突变检测、质量控制等 |
16 | 统计分析 | 样本编号、统计方法、统计结果、P值、样本分组、统计图表等 |
17 | 比较基因组学 | 样本编号、比对结果、基因家族比较、基因注释、基因表达差异、结果可视化等 |
18 | 转录因子分析 | 样本编号、转录因子预测、结合位点预测、GO注释、路径注释、转录因子家族等 |
19 | 多样本分析 | 样本编号、分析方法、统计结果、差异基因、样本分组、多样本比较等 |
20 | 数据可视化 | 数据类型、可视化方法、可视化结果、样本分组、基因表达图、变异频率图等 |