*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据质量控制 | 测序质量、GC含量、N碱基数、错误碱基数、条码信息等 |
2 | 读长过滤 | 最小读长、最大读长、平均读长、中位数读长、N含量等 |
3 | reads去除接头 | 接头序列、接头长度、接头匹配分数、接头定位等 |
4 | 低质量碱基修剪 | 最小质量值、质量值截断、质量值窗口大小、修剪方式等 |
5 | 碱基校正 | 错误碱基校正方式、校正结果、校正率、校正质量值阈值等 |
6 | 重复序列去除 | 重复序列比对方式、比对分数阈值、重复序列统计等 |
7 | 变异检测 | 变异类型、突变位点、突变频率、突变效果等 |
8 | 基因组装 | k:mer大小、碱基覆盖度、连续序列N比例、序列长度等 |
9 | 基因组注释 | 基因名称、基因功能、外显子数目、剪切位点等 |
10 | 基因表达分析 | 差异表达基因、表达量、抑制基因、上调基因等 |
11 | DNA甲基化分析 | 甲基化位点、甲基化水平、甲基化差异、甲基化酶等 |
12 | RNA剪接分析 | 剪接异构体、剪接位点、剪接事件、剪接调控因子等 |
13 | 蛋白质结构预测 | 二级结构、三级结构、结构域、功能位点等 |
14 | 遗传多样性分析 | 遗传多样性指数、群体结构、遗传漂变、遗传距离等 |
15 | 突变效应预测 | 蛋白质功能影响、突变稳定性、突变破坏性、突变酶活性等 |
16 | 基因网络分析 | 蛋白质相互作用、基因共表达网络、功能模块、拓扑分析等 |
17 | 免疫基因预测 | HLA型号、免疫基因编码区、免疫调节因子、免疫疾病相关基因等 |
18 | 基因森林分析 | 随机森林分类器、特征重要性、样本权重、树的数量等 |
19 | 遗传连锁图绘制 | SNP位点、遗传连锁单元、连锁分析结果、连锁距离等 |
20 | 基因突变路径预测 | 突变路径、功能蛋白组、功能注释、突变积累等 |