*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据导入 | 样本编号、数据来源、上机日期、种属信息、测序平台、原始数据文件等 |
2 | 数据质控 | 测序深度、库插入片段大小、重复度、N碱基比例、GC含量、Q30比例等 |
3 | 数据预处理 | 接头修剪、质量值剪切、过滤低质量数据、去除接头污染序列、去除宿主DNA序列等 |
4 | 序列比对 | 参考基因组、比对参数、比对算法、数据库索引、比对结果文件等 |
5 | 变异检测 | 变异类型、基因区域、突变频率、功能注释、位点信息、变异图谱等 |
6 | 基因差异表达 | 差异基因筛选参数、对照组、实验组、差异表达基因列表、功能富集分析结果等 |
7 | RNA结构分析 | RNA二级结构、RNA稳定性预测、结构元件预测、碱基对预测、结构比对等 |
8 | ChIP | DNA元件预测、可视化结果等 |
9 | 全基因组测序分析 | 基因注释、基因变异、基因组结构变异、基因功能富集、染色体可视化等 |
10 | 元转录组分析 | RNA剪接事件、相对表达水平、差异可变剪接、可变剪接事件富集等 |
11 | 微生物组分析 | 物种组成、菌群多样性指数、相对丰度、元基因组注释、稀有种分析等 |
12 | 表观基因组学分析 | DNA甲基化、组蛋白修饰、染色体构象、上游调控分析、序列变异富集等 |
13 | 基因网络分析 | 基因网络构建、模块发现、网络元件功能注释、网络可视化等 |
14 | 细胞单细胞测序 | 单细胞数据分析、群体结构聚类、细胞状态变化、显著差异基因分析等 |
15 | 数据可视化 | 统计图表、热图、散点图、韦恩图、结构图等 |