*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据导入 | 样本编号、实验组、对照组、文库类型、测序平台、测序方法、库类型、数据格式、数据量、数据质量、序列长度、碱基质量值、测序深度、原始数据路径、清洗数据路径、比对参考基因组等 |
2 | 数据预处理 | 数据处理编号、样本编号、数据质控结果、去除低质量序列、过滤未知碱基、微生物去除、去除重复序列、标准化处理、基因表达矩阵、碱基组成分析、基因表达定量标准等 |
3 | 差异表达分析 | 基因编号、基因名称、基因注释、基因组位置、表达丰度、基因差异比较、差异倍数、调整的p值、显著差异基因、基因表达曲线、GO注释、KEGG通路分析等 |
4 | 功能富集分析 | GO功能注释、GO富集分析、GO富集结果、KEGG功能注释、KEGG富集结果、基因本体富集分析、基因本体注释、基因本体富集结果、网络分析、功能模块关联分析等 |
5 | 图谱绘制 | 基因表达热图、散点图、折线图、条形图、饼图、柱状图、点图、帕累托图、散点密度图、网络图等 |
6 | 数据可视化 | 数据导入预览、数据处理可视化、差异基因可视化、功能富集可视化、模块关联可视化、富集结果可视化、图谱绘制预览、数据导出等 |
7 | 基因注释 | 基因序列、基因功能描述、基因结构、翻译产物、转录本、编码影响、基因家族、基因调控、翻译后修饰、基因表达调节等 |
8 | 基因网络分析 | 基因关联网络、蛋白质互作网络、网络度中心性、网络聚类系数、网络图谱、网络预测功能、网络特征分析、关键基因挖掘、MCODE分析、基因网络可视化等 |
9 | 基因调控 | miRNA靶基因、靶基因预测、转录因子靶基因、转录因子预测、启动子区域、顺式作用元件、转录因子结合位点、调控基因表达等 |
10 | 生信分析结果管理 | 数据导入、结果展示、结果导出、数据备份、结果分享、数据可视化、数据统计、数据比较、结果解读、结果更新等 |