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生物转录组管理系统

生物转录组管理系统
生物转录组管理系统是一种基于计算机技术的生物学工具,旨在帮助研究人员分析和管理转录组数据。转录组是指组成生物体基因表达的所有RNA分子,其核心任务是对不同条件下基因的表达进行定量和比较分析,从而揭示基因在不同生物过程中的功能和调控机制。生物转录组管理系统可以帮助研究人员从原始测序数据中进行质量控制和预处理,包括去除低质量序列、修剪适配器等。它还可以进行功能注释,通过与已知的基因和功能数据库进行比对,为转录组数据中的基因提供注释信息。此外,该系统还可以进行差异表达分析,以确定在不同处理或对照条件下表达量显著变化的基因。通过可视化工具,研究人员可以更直观地查看转录组数据的表达模式和差异表达基因的功能富集情况。生物转录组管理系统的优势在于其高度自动化和高效性,大大节省了研究人员的时间和精力。它还提供了对转录组数据的一站式管理和分析,方便研究人员进行综合的生物信息学研究。随着高通量测序技术的发展,生物转录组管理系统在基因表达调控研究、疾病诊断和药物开发等领域具有广阔的应用前景。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 转录组数据导入 样本编号、基因表达量、基因注释、基因差异表达等
2 转录组数据预处理 质量检测、去除低质量碱基、去除接头序列、校正序列错误、拼接序列等
3 转录组数据归一化 TPM、FPKM、RPKM等
4 转录组数据可视化 热图、散点图、折线图、柱状图、地图等
5 差异基因筛选 FDR、P:value等
6 功能富集分析 GO富集分析、KEGG富集分析、生物过程富集、分子功能富集、细胞组分富集等
7 转录因子鉴定 转录因子预测、DNA结合位点预测等
8 SSR标记挖掘 SSR鉴定、SSR位点分析、SSR标记设计、SSR多态性检测等
9 miRNA分析 miRNA预测、miRNA功能注释等
10 lncRNA分析 lncRNA预测等
11 转录组代谢物分析 代谢物预测、代谢物差异分析、代谢物通路分析、代谢物功能注释等
12 转录组重测序分析 SNP检测、InDel检测、SV检测、CNV检测等
13 转录组结构分析 剪切变异检测、转录起始位点识别等
14 转录组进化分析 同源基因检测、焦点进化区域分析、基因家族分类、氨基酸序列比对等
15 操作日志记录 用户登录记录、数据导入记录、分析任务记录、参数修改记录等
TAG标签:生物 / 转录  HOT热度:38
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