*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 转录组数据导入 | 样本编号、基因表达量、基因注释、基因差异表达等 |
2 | 转录组数据预处理 | 质量检测、去除低质量碱基、去除接头序列、校正序列错误、拼接序列等 |
3 | 转录组数据归一化 | TPM、FPKM、RPKM等 |
4 | 转录组数据可视化 | 热图、散点图、折线图、柱状图、地图等 |
5 | 差异基因筛选 | FDR、P:value等 |
6 | 功能富集分析 | GO富集分析、KEGG富集分析、生物过程富集、分子功能富集、细胞组分富集等 |
7 | 转录因子鉴定 | 转录因子预测、DNA结合位点预测等 |
8 | SSR标记挖掘 | SSR鉴定、SSR位点分析、SSR标记设计、SSR多态性检测等 |
9 | miRNA分析 | miRNA预测、miRNA功能注释等 |
10 | lncRNA分析 | lncRNA预测等 |
11 | 转录组代谢物分析 | 代谢物预测、代谢物差异分析、代谢物通路分析、代谢物功能注释等 |
12 | 转录组重测序分析 | SNP检测、InDel检测、SV检测、CNV检测等 |
13 | 转录组结构分析 | 剪切变异检测、转录起始位点识别等 |
14 | 转录组进化分析 | 同源基因检测、焦点进化区域分析、基因家族分类、氨基酸序列比对等 |
15 | 操作日志记录 | 用户登录记录、数据导入记录、分析任务记录、参数修改记录等 |