*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 基因组装 | Contig长度、GC含量、N50值、基因数量、参考序列匹配率等 |
2 | SNPs检测 | 位置、参考基因组、参考基因、等位基因型、位点覆盖度等 |
3 | Indels检测 | 位置、参考基因组、参考基因、插入碱基数、缺失碱基数等 |
4 | 变异注释 | 突变功能、功能影响、保守性分值、基因区域、变异频率等 |
5 | 基因表达定量 | 基因名、表达水平、变异相关性、实验条件、统计显著性等 |
6 | 蛋白质结构预测 | 二级结构、三级结构、动态构象、结构域、距离限制等 |
7 | 基因调控元件分析 | 启动子、结合位点、转录因子、CpG岛、DNA甲基化等 |
8 | 基因家族与进化 | 家族名称、一级分类、家族成员数、模式成员、肽段标识等 |
9 | 基因组比较 | 比较序列、进化分支、基因重排、突变率、共享片段等 |
10 | 表型关联分析 | 表型特征、基因关联、统计指标、显著性阈值、样本大小等 |
11 | 基因功能富集分析 | 通路、GO术语、调控网络、基因集大小、FDR校正等 |
12 | 基因互作网络分析 | 互作关系、网络拓扑、蛋白复合物、模块度、基因中心性等 |
13 | 免疫基因分析 | 抗原表位、T细胞受体、MHC基因、免疫通路、免疫基因组等 |
14 | 疾病关联分析 | 疾病名称、关联SNP、遗传模式、GWAS结果、候选基因等 |
15 | 基因结构预测 | 内含子、外显子、启动子、终止子、间隔区等 |
16 | 基因组条形图 | 染色体位点、染色体长度、基因密度、CpG岛分布、变异密度等 |
17 | 染色体互作分析 | 互作频率、空间距离、染色质结构、聚类模式、染色质修饰等 |