*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 用户管理 | 用户名、密码、姓名、电子邮箱、电话号码、用户权限、注册时间等 |
2 | 实验信息管理 | 实验名称、实验编号、实验日期、实验目的、实验设计、实验人员、实验状态、备注等 |
3 | 样本管理 | 样本名称、样本编号、样本类型、样本处理方法、校验结果、样本数量、样本储存位置、备注等 |
4 | 测序数据管理 | 测序数据编号、测序机器编号、测序方法、测序数据文件、数据质量、数据量、测序状态、备注等 |
5 | 数据预处理 | 预处理方法、去除低质量数据、去除接头序列、去除重复序列、去除未知碱基、序列长度过滤、质量分数过滤、数据统计结果、备注等 |
6 | 对照组分析 | 对照组样本编号、对照组样本组别、对照组样本条件、对照组测序数据编号、对照组数据处理方法、备注等 |
7 | 实验组分析 | 实验组样本编号、实验组样本组别、实验组样本条件、实验组测序数据编号、实验组数据处理方法、备注等 |
8 | GO富集分析 | 分析结果图表、富集分析结果、富集基因列表、富集通路列表、GO注释文件、剪切GO注释文件、注释文件版本、备注等 |
9 | KEGG富集分析 | 分析结果图表、富集分析结果、富集基因列表、富集通路列表、KEGG注释文件、注释文件版本、备注等 |
10 | WGCNA | 共表达网络图谱、模块化分析结果、模块相关性矩阵、模块内基因列表、注释文件、注释文件版本、备注等 |
11 | GO功能富集 | GO注释文件、基因列表、GO注释结果、GO注释图表、注释文件版本、备注等 |
12 | KEGG功能富集 | KEGG注释文件、基因列表、KEGG注释结果、KEGG注释图表、注释文件版本、备注等 |
13 | 数据可视化 | 差异表达热图、PCA分析图、差异基因散点图、火山图、GO富集柱状图、KEGG富集柱状图、WGCNA模块化图、注释文件、注释文件版本、备注等 |
14 | 数据导出 | 实验信息导出、样本信息导出、测序数据导出、预处理结果导出、差异分析结果导出、富集分析结果导出、共表达网络导出、注释文件导出、注释文件版本、备注等 |
15 | 数据分析流程管理 | 流程名称、流程类型、流程描述、流程步骤、参数设置、执行状态、操作记录、创建时间、备注等 |
16 | 数据审查与修正 | 数据质量检查结果、异常数据修正方法、修正结果、修正记录、备注等 |
17 | 差异基因分析 | 差异基因列表、差异基因注释、差异表达图表、差异表达柱状图、差异表达散点图、差异表达数据表格、注释文件、备注等 |
18 | RNA编辑分析 | RNA编辑位点列表、基因编号、基因注释、编辑类型、编辑比例、编辑转录本、编辑序列、注释文件、备注等 |
19 | SNP分析 | SNP位点列表、基因编号、基因注释、SNP类型、SNP频率、SNP转录本、SNP序列、注释文件、备注等 |
20 | CNV分析 | CNV位点列表、基因编号、基因注释、CNV类型、CNV频率、CNV转录本、CNV序列、注释文件、备注等 |