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基因组测序质控管理系统

基因组测序质控管理系统
基因组测序质控管理系统是一种用于管理和监控基因组测序数据质量的软件系统。该系统使用先进的基因组测序技术,通过对DNA或RNA样本进行测序,可以获取大量的遗传信息,包括基因序列和变异等。基因组测序质控管理系统主要包括数据预处理、数据分析和质量评估等功能。首先,系统能够对原始测序数据进行处理,包括去除低质量的碱基、去除接头和过滤掉重复序列等。然后,系统能够对处理后的数据进行比对、拼接和组装,以得到完整的基因组序列。最后,系统会对测序数据的质量进行评估,通过统计学分析和质控指标进行判断,以保证数据的准确性和可靠性。基因组测序质控管理系统具有高效性和可靠性,并能够在大规模测序项目中进行扩展。它不仅可以自动化地处理大量数据,还能够提供详细的质量统计报告和结果展示,以帮助用户进行数据解读和研究分析。此外,基因组测序质控管理系统还支持数据的导入和导出,方便与其他相关软件和数据库进行集成和共享。总之,基因组测序质控管理系统是一种重要的工具,可以帮助科研人员高效地管理和分析基因组测序数据,提高研究的准确性和可信度。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 样本管理 SampleID、样本编号、样本名称、样本类型、样本备注、预期测序目标、文库类型、文库浓度、纯度、样本状态等
2 库构建 Index、反应体积、PCR循环数、温度阶段、总引物浓度、文库浓度、质检结果、质检状态、操作人员、创建时间等
3 文库测序 Read1序列、Read2序列、Index序列、左端截断长度、右端截断长度、最小平均测序深度、测序平台、测序长度、测序芯片、质量控制值等
4 数据处理 数据格式、数据大小、数据质量得分、过滤阈值、错误修复、样本比对、变异检测、基因注释、基因表达分析、数据存储位置等
5 数据分析 样本变异比对、碱基召回率、碱基错误率、Indel比对率、数据库注释、功能富集分析、KEGG通路分析、启动子预测、突变扫描、差异表达基因等
6 质控报告 报告编号、报告标题、报告日期、合格样本数、不合格样本数、质控结果、质控意见、质控人员、批准人员、报告文件等
7 数据导入 导入方式、文件类型、文件路径、导入时间、导入状态、导入结果、导入进度、样本匹配规则、文件解析方式、错误日志等
8 数据导出 导出格式、导出目录、导出样本、导出样本数、导出开始时间、导出结束时间、导出状态、导出结果、导出进度、导出文件等
9 用户管理 用户名、密码、用户类型、邮箱、手机号码、创建时间、上次登录时间、登录次数、用户状态、用户角色等
10 系统设置 系统名称、系统版本、机构信息、数据库配置、邮件配置、消息通知设置、日志记录设置、密码策略、审核流程设置、系统备份配置等
TAG标签:基因组 / 测序 / 质控  HOT热度:51
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