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RNA测序与分析管理系统

RNA测序与分析管理系统
RNA测序与分析管理系统(RNASequencingandAnalysisManagementSystem)是一种用于管理和分析RNA测序数据的软件系统。该系统可帮助研究人员对RNA样本进行测序,并进行后续的数据分析和解读。首先,该系统具备数据管理功能,可以对测序数据进行存储、整理和管理,确保数据的安全性和可追溯性。用户可以方便地查找和访问所需的数据,提高数据利用效率。其次,该系统提供了丰富的数据分析工具和算法,可以对测序数据进行多样性分析,如基因表达水平的定量和差异分析、转录组组装和注释等。这些分析工具可以帮助用户从大量的数据中挖掘出有意义的生物学信息,以加深对基因组中RNA的理解。此外,RNA测序与分析管理系统还允许用户进行数据可视化和交流。用户可以使用系统内置的可视化工具将分析结果以图形化形式展示,从而更直观地理解数据。此外,系统还可以将结果生成报告或分享链接,方便用户之间的交流和合作。综上所述,RNA测序与分析管理系统是一种强大的工具,可将RNA测序数据管理和分析整合于一体,为研究人员提供高效的基因表达研究平台,有助于推动生物医学及生命科学领域的研究进展。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 项目管理 项目名称、项目ID、样本类型、样本来源、表达量单位、测序平台、实验类型、数据分析流程、上机时间、数据分析结果等
2 样本管理 样本ID、样本名称、样本类型、样本来源、样本处理方法、样本存储条件、样本数量、样本质控结果、样本浓度、样本体积等
3 序列质控 样本ID、样本名称、过滤后碱基数、Q20比例、Q30比例、GC含量、N含量、长度分布、过滤前样本数量、过滤后样本数量等
4 数据预处理 样本ID、样本名称、过滤后碱基数、Q20比例、Q30比例、GC含量、N含量、长度分布、过滤前样本数量、过滤后样本数量等
5 转录本组装 样本ID、样本名称、转录本ID、转录本注释、转录本长度、转录本丰度、转录本差异表达、转录本富集分析等
6 基因差异表达 样本ID、样本名称、差异基因ID、差异基因注释、差异基因调控通路、差异基因表达水平、差异基因富集分析等
7 lncRNA分析 样本ID、样本名称、lncRNAID、lncRNA注释、lncRNA长度、lncRNA丰度等
8 mRNA分析 样本ID、样本名称、mRNAID、mRNA注释、mRNA长度、mRNA丰度、mRNA差异表达等
9 miRNA分析 样本ID、样本名称、miRNAID、miRNA注释、miRNA长度、miRNA丰度、miRNA差异表达等
10 lncRNA 样本名称、lncRNAID、lncRNA注释、mRNAID、mRNA注释、共表达差异、共表达富集分析等
11 mRNA 样本名称、mRNAID、mRNA注释、miRNAID、miRNA注释、共表达差异、共表达富集分析等
12 调控网络分析 样本ID、样本名称、调控网络图谱、调控网络拓扑分析、调控网络可视化等
13 GO富集分析 样本ID、样本名称、富集GOTerm、GOTerm注释、GOTerm级别、GOTerm丰度等
14 KEGG富集分析 样本ID、样本名称、Pathway注释、Pathway丰度等
15 GSEA分析 样本ID、样本名称等
16 WGCNA分析 样本ID、样本名称、模块化网络、核心基因、模块:基因关联系数、模块:样本关联系数等
17 神经网络分析 样本ID、样本名称、神经网络拓扑、神经元活动水平、功能融合等
18 CNV分析 样本ID、样本名称、CNV注释、CNV差异表达等
19 SV分析 样本ID、样本名称、结构变异类型、SV位置、SV注释、SV差异表达等
20 遗传变异分析 样本ID、样本名称、突变位点、突变注释、突变频率、突变差异表达等
TAG标签:RNA / 测序 / 分析  HOT热度:37
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