*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据导入 | 文件路径、样本名称、测序方式、数据源、样本类型、数据质量等 |
2 | 数据预处理 | 去除低质量序列、去除接头序列、质控参数设置、测序错误校正、去除冗余序列等 |
3 | 序列比对 | 比对算法选择、引物序列、比对参数设置、比对结果输出、比对质量评估等 |
4 | 变异检测 | 变异类型选择、变异过滤参数、突变频率统计、变异注释、变异位点筛选等 |
5 | CNV检测 | CNV检测算法选择、CNV分析方法、CNV分析参数设置、CNV结果输出、CNV注释等 |
6 | SV检测 | 结构变异类型选择、SV检测算法选择、SV分析参数设置、SV结果输出、SV注释等 |
7 | mRNA表达分析 | 表达量计算方法选择、基因差异表达分析、共表达基因分析、表达热图绘制、表达通路分析等 |
8 | miRNA分析 | miRNA定量分析、差异miRNA筛选、miRNA靶标预测、miRNA通路分析等 |
9 | lncRNA分析 | 等 |
10 | DNA甲基化分析 | 差异甲基化位点筛选、甲基化位点注释、甲基化通路富集分析、甲基化相关基因分析等 |
11 | ChIP | 差异peak筛选、peak注释、peak富集分析、motif分析等 |
12 | GO功能富集分析 | 富集分析方法选择、统计修正方法选择、GO注释、GO富集结果、富集图绘制等 |
13 | 调亚结构分析 | 原始数据输入、亚结构分析方法选择、调控模式预测、模式识别结果输出、调亚结构可视化等 |
14 | M | 网络分析参数设置、模块度计算、基因集富集分析、可视化展示等 |
15 | 突变拓扑分析 | 突变拓扑参数设置、拓扑分析方法选择、突变网络构建、节点中心性计算、突变网络可视化等 |
16 | miRNA | 调控网络构建、调控子网络挖掘、调控网络统计分析等 |
17 | 网络图可视化 | 网络数据输入、网络布局算法选择、节点颜色设置、边的宽度设置、网络导出等 |
18 | 数据导出 | 导出文件类型选择、导出路径设置、导出数据筛选参数、导出结果可视化参数、导出结果等 |