*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 基因组数据导入 | 样本ID、项目ID、文件路径、文件格式、文件大小、上传日期、存储位置、数据质量等 |
2 | 数据预处理 | 样本ID、数据清洗方法、过滤参数、去除低质量序列、去除接头序列、数据长度等 |
3 | 序列比对 | 样本ID、参考基因组、比对算法、比对参数、相对位置、比对质量、比对覆盖度等 |
4 | 变异检测 | 样本ID、变异类型、检测算法、检测参数、变异位置、变异频率、变异质量、功能影响等 |
5 | 功能注释 | 变异信息、参考基因组、功能数据库、注释算法、注释结果、功能注释质量等 |
6 | 基因表达分析 | 样本ID、表达数据、对照组、分组方案、差异分析方法、差异基因列表、表达模式等 |
7 | 基因网络分析 | 差异基因列表、PPI网络数据、拓扑参数、共表达网络、模块度分析、关键节点等 |
8 | 通路分析 | 差异基因列表、通路数据库、通路富集分析方法、通路富集分析结果、通路富集质量、通路数目等 |
9 | 生物标记物发现 | 样本ID、生物标记物类型、生物标记物筛选算法、生物标记物筛选参数、生物标记物质量等 |
10 | 数据可视化 | 样本ID、数据可视化方法、可视化参数、可视化结果、可视化质量等 |