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序列质量控制管理系统

序列质量控制管理系统
序列质量控制管理系统(SequenceQualityControlManagementSystem)是一种用于管理和控制DNA或RNA测序数据质量的软件系统。该系统旨在提高测序数据准确性和可靠性,并确保结果的一致性和可比性。该系统通常包括以下主要功能:首先,数据预处理,包括读取和解析原始测序数据,并去除低质量的序列。其次,数据质量评估,通过计算测序数据的质量指标,如测序错误率、碱基质量值和测序深度等,来评估数据的准确性和可靠性。接下来,数据过滤和修复,通过对低质量序列的过滤和对错误序列的修复,可以提高数据的准确性和一致性。最后,结果分析和报告,通过对经过质检和处理后的数据进行分析和统计,生成高质量的测序结果,并生成相应的报告。序列质量控制管理系统广泛应用于基因组学、转录组学和生物信息学等领域中,对于研究和应用中的测序数据质量的保证至关重要。通过使用序列质量控制管理系统,研究人员可以获得准确可靠的测序结果,进而在基因功能注释、突变检测、表达定量等研究中提供更可靠的基础数据。同时,该系统还能够提高测序实验的效率,并减少人工操作的错误和偏差,提高实验结果的可比性和一致性。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 数据导入 样本编号、序列数据、质量分数、碱基数目、过滤结果、外部链接、属名、种名、基因名称、参考序列等
2 质量评估 平均碱基质量、GC含量、错误率、N含量、碱基分布、过滤结果、排序结果、相似序列、短尾序列、读长分布等
3 序列过滤 最小质量阈值、最小长度阈值、过滤结果、剩余序列数、过滤比例、过滤分类、过滤类型、过滤原因、数量统计、统计结果等
4 序列修剪 修剪位置、修剪长度、修剪结果、序列编号、切割位点、添加标签、切割序列、序列方向、切割类型、全部修剪等
5 碱基替换 目标序列、替换位置、替换碱基、替换结果、替换方式、属性条件、替换类型、替换次数、替换编号、多序列替换等
6 序列合并 合并序列、合并结果、合并位置、合并方式、合并标签、合并编号、合并长度、合并分类、合并类型、批量合并等
7 冗余序列检测 冗余序列、相似度阈值、冗余结果、冗余位置、冗余类型、冗余编号、冗余比例、冗余分类、冗余长度、批量检测等
8 基因分析 SNP分析、INDEL分析、位点注释、突变检测、空缺分析、结构预测、功能预测、突变类型、其他修饰、突变频率等
9 异常序列检测 异常序列、比对结果、异常位置、异常类型、异常编号、异常长度、异常分类、异常原因、异常信息、比对方式等
10 数据导出 导出格式、导出结果、导出位置、导出条件、导出编号、导出分类、导出类型、导出样本、数据选择、导出链接等
11 多样本比较 比较结果、比较方式、比较位置、比较条件、比较分类、比较类型、比较样本、比较编号、比较标准、比较名称等
12 样本管理 样本编号、样本信息、样本属性、样本分类、样本类型、样本状态、样本来源、样本保存、样本位置、样本描述等
13 质量控制报告 报告结果、报告生成、报告导出、报告格式、报告位置、报告编号、报告分类、报告样本、报告时间、报告链接等
14 数据备份 备份位置、备份结果、备份方式、备份条件、备份分类、备份类型、备份样本、备份时间、备份编号、备份大小等
15 数据恢复 恢复位置、恢复结果、恢复方式、恢复条件、恢复分类、恢复类型、恢复样本、恢复时间、恢复编号、恢复大小等
16 用户权限管理 用户管理、权限设定、角色分配、密码重置、权限调整、用户登录、用户注册、用户信息、用户组管理、登录日志等
17 数据查询 查询条件、查询结果、查询位置、查询方式、查询分类、查询类型、查询样本、查询编号、查询标签、查询链接等
18 序列比对 比对结果、比对位置、比对方式、比对条件、比对分类、比对类型、比对样本、比对编号、比对标签、比对链接等
19 计算任务管理 任务列表、任务状态、任务设置、任务进度、任务编号、任务分类、任务类型、任务样本、任务结果、任务日志等
20 用户日志 日志记录、日志导出、日志位置、日志分类、日志类型、日志编号、日志时间、日志用户、日志操作、日志链接等
TAG标签:序列 / 质量 / 控制  HOT热度:45
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