全国用户服务热线

SNP分析与筛选管理系统

SNP分析与筛选管理系统
SNP分析与筛选管理系统是一种基于单核苷酸多态性(SingleNucleotidePolymorphism,SNP)的数据分析和筛选的管理系统。SNP是一种常见的基因突变形式,通过分析SNP可以对个体间的基因差异进行研究,并找出与某种特定性状或疾病相关的基因。SNP分析与筛选管理系统主要包括数据采集、数据处理与分析、基因筛选与挖掘等功能。首先,系统通过各种实验方法采集到大量的SNP数据,包括基因组测序、芯片芯片技术等。然后,系统将采集到的数据进行预处理和标注,去除无效数据和错误标记,同时提取出有用的SNP信息。接下来,系统利用相关的算法和统计方法对SNP数据进行分析,通过比较不同个体之间的SNP差异来寻找与特定性状或疾病相关的SNP。最后,系统根据分析结果进行基因筛选与挖掘,找出最具有关联性的SNP组合,并评估其对目标性状或疾病的影响程度。同时,系统也提供了相关的可视化工具和结果展示功能,帮助用户直观地理解和解释SNP分析结果。SNP分析与筛选管理系统的应用领域非常广泛,包括人类遗传学研究、农业育种、动物遗传改良等。通过该系统,用户可以更加高效地进行SNP数据分析和筛选,为疾病诊断、个性化医疗以及农作物和动物的优化育种提供科学依据。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 SNP数据导入 样本编号、染色体位置、参考基因型、变异基因型、筛选标志、读数、合格指标、导入时间、导入人员、导入来源等
2 质控 样本编号、导入时间、导入人员、缺失率、杂合率、MAF、HWE检验、近缘关系分析、异常位点检测、质控结论等
3 生物信息学分析 样本编号、导入时间、导入人员、PLINK结果、PCA分析结果、迁移树结果、Fst结果、比较分析结果等
4 遗传统计 样本编号、导入时间、导入人员、群体构成、群体遗传分析、遗传模型分析、基因关联分析、出现频率分析、特定位点统计、遗传指标计算等
5 病理分析 样本编号、导入时间、导入人员、疾病类型、病理结果、病理评级、病理报告、病理图像、病理解读、病理诊断建议等
6 功能注释 样本编号、导入时间、导入人员、基因ID、基因名称、SNP影响的功能、功能通路、基因表达谱、功能注释数据库、功能注释结果等
7 筛选条件设置 样本编号、导入时间、导入人员、窗口大小、种群频率阈值、HWE检验阈值、杂合率阈值、MAF阈值、筛选标记、筛选结果等
8 可视化 样本编号、导入时间、导入人员、热图展示、散点图展示、突出位点图、条形图展示、分布图展示、相关性图、框图展示、树状图展示、群体结构图等
9 数据导出 样本编号、导入时间、导入人员、导出格式、导出字段、导出样本、导出数据量、导出文件名、导出路径、导出时间等
10 系统管理 用户管理、权限管理、系统设置、登录日志、操作日志、数据备份、数据恢复、系统更新、数据清理、审计日志等
TAG标签:SNP / 分析 / 筛选  HOT热度:39
主页 QQ 微信 电话
展开