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基因组序列质量控制管理系统

基因组序列质量控制管理系统
基因组序列质量控制管理系统是一种用于评估和管理基因组序列质量的软件系统。该系统可以帮助研究人员在测序过程中识别和纠正可能出现的错误,提高测序数据的准确性和可靠性。该系统主要包括以下功能:1.数据质量评估:系统可以对测序数据进行全面的质量评估,包括测序错误率、测序深度、碱基分布等指标。通过分析这些指标,研究人员可以了解测序数据的可靠性并做出相应的处理措施。2.数据过滤和修剪:系统可以根据研究人员设置的阈值,自动过滤和修剪测序数据中的低质量碱基或序列片段。这样可以提高测序数据的准确性,并去除可能影响后续分析结果的噪音。3.异常样本识别:系统可以识别测序数据中的异常样本,例如低测序深度样本、重复样本或潜在污染样本。这有助于研究人员及时发现问题,并采取相应的措施以确保数据的准确性和可靠性。4.数据管理:系统可以对处理后的测序数据进行有效的管理和存储,包括数据备份、归档和文档记录。这使得研究人员能够方便地回溯和查阅数据,并保证数据的长期保存和安全性。基因组序列质量控制管理系统的使用可以提高基因组测序研究的效率和准确性,为后续的数据分析和解读提供可靠的基础。随着测序技术的持续发展,该系统也将不断完善和更新以满足科研人员对高质量数据的需求。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 样本管理 样本ID、样本名称、样本条码、样本类型、样本存储位置、样本描述、操作人员、创建时间、修改时间、备注等
2 测序质控 样本ID、样本名称、碱基数、N率、GC含量、Q30比例、过滤比例、错误率、操作人员、创建时间、修改时间等
3 数据分析 样本ID、样本名称、比对率、基因覆盖度、基因注释、变异分析、功能富集分析、操作人员、创建时间、修改时间、备注等
4 质量报告 样本ID、样本名称、质量评估结果、数据分析结果、质控图表、结果解读、操作人员、创建时间、修改时间、备注等
5 质控参数配置 参数名称、参数类型、参数数值、参数单位、参数描述、操作人员、创建时间、修改时间、备注等
6 可视化分析 样本ID、样本名称、测序深度、突变频率、重复性分析、热图、操作人员、创建时间、修改时间等
7 质控流程管理 流程名称、流程描述、流程步骤、流程参数、操作人员、创建时间、修改时间、备注等
8 数据导入 文件名称、文件类型、导入方式、数据格式、数据源、目标文件夹、操作人员、导入时间、备注等
9 数据导出 文件名称、文件类型、导出方式、数据格式、目标文件夹、操作人员、导出时间、备注等
10 质控统计 样本ID、样本名称、测序总数、平均碱基数、最小碱基数、最大碱基数、平均N率、最小N率、最大N率、操作人员、创建时间、修改时间等
TAG标签:基因组 / 序列 / 质量 / 控制  HOT热度:47
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