*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据导入 | 样本编号、序列数据文件路径、样本信息文件路径、测序平台等 |
2 | 数据清洗 | 低质量过滤阈值、连接序列阈值、N过滤等 |
3 | 碱基校正 | 校正方法、校正参数、错误率、校正模型等 |
4 | 质量分析 | 序列长度、N含量、碱基质量、质量分数分布等 |
5 | 低复杂度序列过滤 | 最小重复数阈值、最小窗口大小、最小熵阈值等 |
6 | 主成分分析 | 主成分个数、主成分结果文件、样本类别文件等 |
7 | 异质SNP检测 | 基因组文件路径、参考序列路径、比对算法、SNP筛选参数等 |
8 | 突变检测 | 样本编号、基因组文件路径、参考序列路径、比对算法、突变筛选参数等 |
9 | 缺失对分析 | 样本编号、基因组文件路径、参考序列路径、比对算法、缺失对筛选参数等 |
10 | DNA甲基化分析 | 样本编号、基因组文件路径、参考序列路径、比对算法、甲基化分析参数等 |
11 | 差异表达分析 | 实验组样本编号、对照组样本编号等 |
12 | GO富集分析 | 基因列表文件路径、基因组文件路径、GO注释文件路径、显著性水平阈值等 |
13 | KEGG富集分析 | 基因列表文件路径、基因组文件路径、显著性水平阈值等 |
14 | 差异剪接分析 | 基因组文件路径、参考基因组文件路径、剪接事件类型、剪接分析参数等 |
15 | SSR寻找 | 基因组文件路径、最小重复次数、最大重复次数、最小重复长度等 |
16 | SNP统计 | 基因组文件路径、参考序列路径、比对算法、控制参数等 |
17 | 突变统计 | 基因组文件路径、参考序列路径、比对算法、控制参数等 |
18 | 染色体结构分析 | 基因组文件路径、参考基因组文件路径、参考基因文件路径、分析参数等 |
19 | 突变功能预测 | 基因ID、突变位置、参考碱基、突变碱基、功能预测算法等 |