全国用户服务热线

基因序列组装和比对管理系统

基因序列组装和比对管理系统
基因序列组装和比对管理系统是基因组学研究中广泛使用的重要工具。它们的主要功能是将测序得到的碱基序列数据进行组装和比对,从而得到完整的基因组序列信息。基因序列组装是将测序得到的碱基序列片段通过寻找重叠序列来拼接成较长的连续序列。这个过程中需要考虑片段的序列质量和错误纠正,同时也需要解决复杂的重叠关系和重复序列等问题。基因序列组装算法的设计和优化是组装系统关注的重点。基因序列比对是将一条已知的基因序列与已知的参考基因组序列进行比较,找出相似的区域。比对常用的算法包括全局比对和局部比对两种。全局比对用于查找相似性较高的序列,而局部比对则用于查找特定区域的相似性。管理系统是指用于存储、管理和分析基因组序列数据的软件系统。这些系统可以对大量的序列数据进行管理,包括存储测序数据、组装结果和比对结果等。管理系统还可以提供数据可视化和分析功能,辅助研究人员进行基因组学研究。基因序列组装和比对管理系统在基因组学研究和生物信息学领域发挥着重要作用。它们可以帮助研究人员更好地理解基因组的结构和功能,为进一步的基因研究提供重要的支持。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 仪器管理 仪器编号、仪器型号、出厂日期、仪器状态、使用者、出借日期、归还日期、维修记录、备注等
2 样本管理 样本编号、样本类型、样本来源、采集日期、采集地点、保存方式、保存温度、样本状态、已提取数量、备注等
3 数据导入 导入文件路径、导入日期、导入者、数据类型、数据格式、文件大小、导入状态、导入结果、导入日志、备注等
4 序列预处理 序列ID、序列质量、剪切位置、去除低质量数据、去除接头序列、去除低复杂性序列、去除rRNA序列、去除tRNA序列、去除探针序列、备注等
5 序列比对 比对方法、参考序列、序列相似度、比对得分、比对位置、比对质量、比对统计信息、备注等
6 序列组装 组装方法、组装算法、组装得分、组装碱基数、组装GC含量、组装覆盖率、组装结果、备注等
7 结果浏览 浏览类型、浏览方式、浏览结果、浏览位置、浏览评分、浏览质量、备注等
8 基因注释 注释方法、注释结果、功能注释、通路注释、结构注释、表达注释、备注等
9 多样本比较 比较方法、比较分组、差异基因筛选、差异基因注释、差异基因表达量、差异基因富集分析、备注等
10 数据导出 导出类型、导出文件路径、导出日期、导出者、导出结果、导出状态、导出日志、备注等
TAG标签:基因 / 序列 / 组装 / 比对  HOT热度:45
主页 QQ 微信 电话
展开