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基因表达分析工具

基因表达分析工具
基因表达分析工具是一种用于研究基因表达水平的计算机软件或在线平台。这些工具帮助科学家在基因组中识别和量化基因表达的变化,从而揭示基因在生物过程中的功能。基因表达分析工具主要包括以下几个方面的功能:数据预处理,包括质控和数据归一化;差异表达分析,用于发现在不同条件下表达水平明显变化的基因;聚类分析,用于将基因分组成不同表达模式的簇;基因注释,帮助解释基因功能和关联生物过程;生物网络分析,用于识别基因间的相互作用和调控关系;基因富集分析,帮助确定在某个生物学过程中显著富集的基因集。常用的基因表达分析工具包括R/Bioconductor、DESeq2、edgeR、clusterProfiler等。这些工具使科学家能够更深入地理解基因与疾病、发育和生物过程之间的关系,并为药物开发和个性化医疗提供重要的指导。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 数据预处理 样本编号、组别标签、表达量、差异表达基因、种群分布等
2 差异分析 差异表达基因、统计显著性、调控基因、筛选门槛等
3 功能富集分析 基因集、通路富集、GO富集、KEGG富集、过滤条件等
4 可视化 热图、散点图、折线图、柱状图、韦恩图等
5 模块分析 WGCNA、GO注释、KEGG注释、相关系数、模块标记等
6 网络分析 基因互作网络、共表达网络、功能地图、蛋白质相互作用网络、网络图布局等
7 基因注释 基因符号转换、基因ID注释、功能注释、模块注释、GO注释等
8 生存分析 生存率分析、生存时间、生存分组、生存统计学显著性等
9 聚类分析 层次聚类、K:means聚类、共表达网络聚类、组分聚类、距离测量等
10 多组比较 ANOVA、T检验、多重检验校正等
TAG标签:基因 / 表达 / 分析 / 工具  HOT热度:46
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