*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据质控 | 序列长度、序列质量、N碱基含量、GC含量、过滤序列等 |
2 | 读取 | 读取FASTQ文件、解析FASTQ文件、读取FASTA文件、解析FASTA文件等 |
3 | 序列操纵 | 序列翻译、序列反向互补、序列转换、序列修剪、序列拼接等 |
4 | 比对 | 全局比对、局部比对、拼接比对等 |
5 | 变异检测 | 单核苷酸多态性检测、结构变异检测、人类单倍型分析、比对遗漏检测、杂合基因检测等 |
6 | 注释 | 功能注释、变异注释、通路注释、基因本体注释、疾病关联注释等 |
7 | 基因表达 | 差异表达分析、基因表达定量、转录本定量、双融合基因检测、缺失基因检测等 |
8 | 结构预测 | 二级结构预测、三级结构预测、蛋白质折叠预测、蛋白质域边界预测、蛋白质互作预测等 |
9 | 基因家族分析 | 同源序列聚类、推断家族成员、家族进化树构建、家族保守位点分析、重复元件寻找等 |
10 | 基因组组装 | 基因组碱基组装、重复序列过滤、基因组碱基修复、基因组结构分析、转座子寻找等 |