*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据导入 | 样本编号、样本文件、样本信息、数据类型、数据质量、数据来源、数据上传时间、数据量控制、数据预处理方法、数据预处理参数等 |
2 | 数据清洗 | 质控阈值、低质量数据过滤、去除低复杂度序列、去除PCR重复、污染序列去除、杂交序列去除、数据处理方法、清洗后数据量、清洗后数据比例等 |
3 | 序列比对 | 比对算法、比对参数、比对结果、比对质量、比对效率、比对工具、比对参考序列、比对覆盖范围、比对覆盖度、比对配对率等 |
4 | 序列注释 | 注释数据库、注释方法、注释结果、注释质量、注释工具、注释类型、注释参考信息、注释覆盖范围、注释覆盖度、注释可信度等 |
5 | 多序列比对 | 多序列比对算法、多序列比对参数、多序列比对结果、多序列比对质量、多序列比对工具、多序列比对参考序列、多序列比对覆盖范围、多序列比对覆盖度、多序列比对配对率等 |
6 | 基因组装 | 组装算法、组装参数、组装结果、组装质量、组装工具、组装参考序列、组装覆盖范围、组装覆盖度、组装连续性等 |
7 | 基因表达量计算 | 表达量计算方法、表达量计算参数、表达量计算结果、表达量计算质量、表达量计算工具、表达量计算控制、表达量计算精度、表达量计算准确性等 |
8 | 差异表达分析 | 差异分析方法、差异分析参数、差异分析结果、差异分析质量、差异分析工具、差异分析参考基因组、差异分析阈值、差异基因筛选、差异基因注释、差异基因表达图等 |
9 | 功能富集分析 | GO富集分析方法、GO富集分析参数、GO富集分析结果、GO富集分析质量、GO富集分析工具、GO富集分析阈值、GO富集分析图表、GO富集分析通路等 |
10 | 通路富集分析 | 通路富集分析方法、通路富集分析参数、通路富集分析结果、通路富集分析质量、通路富集分析工具、通路富集分析阈值、通路富集分析图表等 |
11 | 蛋白质结构预测 | 结构预测算法、结构预测参数、结构预测结果、结构预测质量、结构预测工具、结构预测参考蛋白质、结构预测覆盖范围、结构预测覆盖度、结构预测连续性等 |
12 | 通路网络分析 | 通路网络分析方法、通路网络分析参数、通路网络分析结果、通路网络分析质量、通路网络分析工具、通路网络分析节点、通路网络分析边缘、通路网络分析可视化等 |
13 | 微生物组分析 | 微生物组分析方法、微生物组分析参数、微生物组分析结果、微生物组分析质量、微生物组分析工具、微生物组丰度评估、微生物组群落组成、微生物组功能预测、微生物组环境关联性等 |
14 | 免疫组库分析 | 免疫组库分析方法、免疫组库分析参数、免疫组库分析结果、免疫组库分析质量、免疫组库分析工具、免疫组库衍生物预测、免疫组库样本比较、免疫组库表达定量、免疫组库通路富集等 |
15 | 肿瘤突变分析 | 突变分析方法、突变分析参数、突变分析结果、突变分析质量、突变分析工具、突变分析参考基因组、突变分析过滤条件、突变分析突变类型、突变分析突变频率、突变分析突变通路等 |
16 | miRNA分析 | miRNA分析方法、miRNA分析参数、miRNA分析结果、miRNA分析质量、miRNA分析工具、miRNA差异分析、miRNA功能预测、miRNA表达定量等 |
17 | lncRNA分析 | 等 |
18 | DNA甲基化分析 | 甲基化分析方法、甲基化分析参数、甲基化分析结果、甲基化分析质量、甲基化分析工具、甲基化位点鉴定、甲基化水平调整、甲基化差异分析、甲基化通路富集等 |
19 | 数据导出 | 导出格式、导出文件、导出设置、导出内容、导出结果、导出时间、导出路径、导出权限、导出日志、导出操作人员等 |