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序列比对与测序管理系统

序列比对与测序管理系统
序列比对是指将两个或多个基因组序列或蛋白质序列进行比较,根据相似性来寻找它们之间的共同特征或变异部分。这种比对可以帮助研究人员理解生物体的进化关系、功能和结构等。序列比对的过程通常涉及两个主要步骤:1)构建一个对齐模型,以确定序列中相应的位置;2)利用算法来计算两个序列之间的相似度。测序管理系统是指用于管理和处理大量测序数据的软件系统。随着高通量测序技术的发展,产生的测序数据量呈指数级增长,这就需要一个高效的系统来管理这些数据。测序管理系统可以实现对测序数据的质量控制、预处理、数据存储与检索、样品追踪等功能,同时还可以提供一系列的工具和算法来进行序列比对、变异检测、基因表达分析等。在序列比对与测序管理系统中,常用的比对工具有BLAST、Bowtie、BWA等,用于比对不同类型的序列数据;而测序管理系统则有IndependentSequenceIntegrationandAnalysisSystem(ISA)、BaseSpace等,可以帮助研究人员管理和分析测序数据。这些系统的使用可以大大提高测序数据的处理效率和分析准确性,为生命科学研究提供了强大的支持。

系统版本1

*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!

编号 模块名称 字段参数
1 用户管理 用户名、密码、角色、邮箱、手机号等
2 样本管理 样本编号、样本名称、样本类型、所属项目、采样日期、采样地点等
3 文库构建 文库编号、文库名称、文库类型、样本编号、构建日期、文库浓度等
4 测序上机 测序编号、文库编号、测序批次、测序芯片、上机流量、上机日期等
5 数据质控 测序编号、过滤比例、未配对比例、低质量比例、内部重复比例等
6 序列比对 测序编号、比对算法、参考基因组、比对结果、比对率、GC含量等
7 变异检测 测序编号、变异类型、频率、基因名、位置、功能等级等
8 批注注释 变异编号、基因名、功能等级、基因区域、功能作用、疾病关联等
9 差异表达分析 测序编号、对照组、实验组、差异基因、调控方向、P值等
10 数据可视化 样本编号、测序编号、变异类型、差异基因、异常位点、样本分类等
11 数据导入导出 文件格式、导入对象、导入方式、导出对象、导出方式等
12 数据查询 样本编号、测序编号、变异类型、差异基因、基因名、位置等
13 数据统计 样本数量、文库数量、测序数量、变异数量、差异基因数量等
14 报告生成 测序编号、样本编号、检测结果、报告模板、生成日期等
15 任务分配 任务编号、分配人员、执行人员、任务类型、截止日期等
16 操作日志 用户编号、操作类型、操作对象、操作描述、操作时间等
17 系统设置 管理员账号、管理员密码、系统名称、版本号、授权信息等
18 通知提醒 接收人员、通知内容、发送时间、阅读状态、回复状态等
19 客户管理 客户编号、客户姓名、客户类型、客户联系人、联系电话等
20 项目管理 项目编号、项目名称、项目负责人、项目状态、创建日期、完成日期等
TAG标签:序列 / 比对 / 测序  HOT热度:36
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