*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据导入 | 文件名、样品编号、样品类型、测序平台、测序技术等 |
2 | 数据预处理 | 去除接头序列、去除低质量碱基等 |
3 | 参考基因组映射 | 参考基因组、对齐算法、比对得分、相对位置、区域覆盖度等 |
4 | 变异检测 | SNP、InDel、变异频率、功能注释、突变影响预测等 |
5 | CNV检测 | 拷贝数变异、拷贝数状态、扩增区域、缺失区域、平均拷贝数等 |
6 | SV检测 | 结构变异、融合基因、插入段、删除段、漏合段等 |
7 | RNA | 差异表达分析、基因富集分析、Pathway分析、lncRNA识别等 |
8 | ChIP | 峰区域注释、基因关联分析、DNA结合位点预测、云图可视化等 |
9 | MeDIP | CpG岛注释、甲基化水平计算、基因关联分析、可视化统计图等 |
10 | 元基因组分析 | 物种鉴定、基因组组装、基因簇注释、功能预测、抗生素抗性检测等 |
11 | 直链观测分析 | 标准散点图、扩增子多样性、群落结构分析、Beta多样性指数等 |
12 | 基因编辑 | CRISPR设计、敲除效果评估、敲入效率评估、编辑位点鉴定、突变鉴定等 |
13 | 基因网络分析 | 共表达网络构建、模块识别、功能模块注释、中心度计算、可视化展示等 |
14 | 功能富集分析 | GO富集分析、KEGG通路分析、反向富集分析、网络富集分析、功能模块注释等 |
15 | 基因组可视化 | 基因组轨道绘制、可视化基因组比对、热图可视化、多样本比较、染色体结构可视化等 |
16 | 数据统计与报告 | 样品数量统计、数据质控报告、低质量碱基分布图、富集区域图、系统操作日志等 |
17 | 用户管理 | 注册用户管理、权限设置、用户组管理、个人资料修改、用户活动日志等 |
18 | 数据备份与恢复 | 数据备份策略、数据备份操作、数据恢复操作、数据备份日志、空间占用统计等 |