*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 导入数据 | DNA序列文件、序列长度、测序质量、空格处理、质量值阈值、测序方法等 |
2 | 数据质控 | 测序质量过滤、长度过滤、质量值过滤、重复序列过滤、低质量序列过滤等 |
3 | 去除冗余 | 去除重复序列、去除冗余序列、比对查找重复序列、标记重复序列等 |
4 | 序列比对 | 参考序列选择、较长比对、全局比对、Sam文件输出、可视化比对结果等 |
5 | 变异检测 | SNP检测、INDEL检测、变异频率计算、过滤多态性位点等 |
6 | DNA修复 | 损伤位点修复、SNP修复、INDEL修复、修复效果评估等 |
7 | 数据过滤 | 过滤SNPs、过滤INDELs、过滤低频变异位点、过滤高频变异位点等 |
8 | 变异注释 | 功能预测、修饰效应注释、变异位点数据库查询、变异通路分析等 |
9 | 数据可视化 | 序列长度分布图、测序质量分布图、等位基因频率柱状图、SNP分布图等 |
10 | 数据导出 | 导出过滤后的序列、导出变异位点信息、导出注释结果、导出可视化图形等 |