*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据导入 | 文件名、样本编号、样本类型、位置信息、样本描述、其他相关信息等 |
2 | 数据预处理 | 质量控制值、去除低质量数据、去除噪声数据、样本对齐、修正测序错误、样本去重等 |
3 | 序列比对 | 参考序列、比对算法、比对参数、比对评分、比对结果等 |
4 | 序列聚类 | 聚类算法、相似度计算方法、聚类结果等 |
5 | 物种分类 | 分类算法、参考数据库、分类结果等 |
6 | 遗传多样性分析 | 核苷酸多样性、氨基酸多样性、遗传距离、遗传多样性指数、等位基因频率等 |
7 | 物种丰度分析 | 物种丰度计算方法、物种丰度统计、物种组成比例、物种丰度分布等 |
8 | 群落结构分析 | 物种组成、物种相对丰度、群落相似度、群落分类、群落功能预测等 |
9 | 进化树构建 | 进化模型、进化距离计算方法、进化树构建算法、进化树可视化等 |
10 | 群落功能预测 | 基于KO、COG、功能丰度分析、功能组成比例、功能关联网络等 |
11 | 群落互作网络分析 | 物种互作关系、网络拓扑结构、网络模块及中心性、互作网络可视化等 |
12 | 生物标志物分析 | 差异丰度物种挑选、生物标志物鉴定、生物标志物可视化等 |
13 | 动态群落分析 | 群落动态变化、动态群落分型、动态物种组成等 |
14 | 群落功能关联 | 功能环境响应关系、功能关联网络可视化等 |
15 | 基因组装 | 序列拼接、组装算法、组装参数、组装质量评估、组装结果等 |
16 | 变异检测 | 变异检测算法、突变位点识别、基因型预测、变异注释、变异频率统计等 |
17 | 宏基因组分析 | 基因组大小评估、基因丰度计算、基因组功能注释、宏基因组组成、基因组功能富集等 |
18 | 基因共现分析 | 基因共现计算算法、共现网络分析、共现关系统计、共现网络可视化等 |
19 | 基因表达分析 | 差异表达基因筛选、基因表达差异分析、基因表达聚类、基因表达热图、基因表达通路分析等 |
20 | 数据可视化 | 样本聚类热图、物种丰度柱状图、进化树可视化、功能关联网络可视化、变异频率分布图等 |