*本系统功能模块、字段参数,均可结合用户实际业务需求调整,可增可减,以达到最佳业务管理流程的体验!
编号 | 模块名称 | 字段参数 |
1 | 数据导入 | 样本编号、序列文件、项目名称、样本类型、实验日期、实验人员、序列生成平台、序列长度、序列质量等 |
2 | 数据清洗 | 样本编号、过滤后序列文件、平均测序深度、过滤百分比、过滤前序列数、过滤后序列数、过滤原因等 |
3 | 参考序列管理 | 参考序列名称、参考序列文件、物种、参考序列长度、物种类别、版本号等 |
4 | 序列比对 | 样本编号、比对后文件、比对算法、比对得分、比对率、比对覆盖度、比对时间等 |
5 | 序列注释 | 样本编号、注释信息、功能注释结果等 |
6 | SNP分析 | 样本编号、变异类型、位点位置、参考碱基、变异碱基、碱基质量、深度、倍性、碱基频率、功能注释等 |
7 | Indel分析 | 样本编号、变异类型、位点位置、参考序列、插入序列、删除序列、碱基质量、深度、倍性、功能注释等 |
8 | 基因型分析 | 样本编号、多态性位点、基因型、基因频率、基因型质量、功能注释等 |
9 | 基因组结构分析 | 样本编号、结构变异类型、变异位置、参考序列、变异序列、结构特征、功能注释等 |
10 | 突变热图 | 样本编号、突变类型、突变位置、突变频率、功能注释等 |
11 | KEGG通路分析 | 样本编号、通路名称、参与基因数、通路注释、通路分析结果等 |
12 | GO富集分析 | 样本编号、GO注释、参与基因数、GO富集结果等 |
13 | Pfam富集分析 | 样本编号、Pfam注释、参与基因数、Pfam富集结果等 |
14 | 可变剪接分析 | 样本编号、剪接事件类型、剪接位置、参考序列、变异序列、剪接程度、功能注释等 |
15 | RNA编辑分析 | 样本编号、编辑类型、编辑位置、参考序列、编辑碱基、覆盖度、功能注释等 |
16 | 共表达基因分析 | 样本编号、共表达基因、共表达模式、功能注释等 |
17 | 可变表达分析 | 样本编号、可变表达基因、可变表达模式、功能注释等 |
18 | 差异基因筛选 | 样本编号、差异基因、差异基因类型、差异基因注释等 |
19 | 网络分析 | 样本编号、互作蛋白、互作关系、关键模块、功能注释等 |
20 | 可视化 | 样本编号、数据图表、结果可视化、参数设置等 |